A quanto pare, il nuovo capitolo di Deus Ex si distinguerà dal precedente anche dallo stile grafico, che ha abbandonato quella particolare colorazione "arancione-gialla" che dominava in Human Revolution.
C'era una motivazione a tale scelta, infatti: in base a quanto riferito da Jacques-Belletete di Eidos Montreal a OXM, tali colori erano stati utilizzati per simboleggiare il riferimento al Rinascimento, che era menzionato nella storia collegato alla vicenda del Transumanesimo, per ricordare in qualche modo i quadri del periodo storico. Essendo ambientato in un'epoca dominata da tematiche diverse, Deus Ex: Mankind Divided avrà anche un aspetto differente.
I temi sono maggiormente riferibili al medioevo, ha spiegato lo sviluppatore, pertanto i filtri grafici portano ad una dominanza dei colori desaturati, con blu, grigio e marrone evidenti. "Deus Ex: Mankind Divided sarà molto meno color urina", ha riferito lo sviluppatore con una curiosa scelta di termini.