Secondo quanto riportato dalla rivista nipponica Famitsu, a meno di due mesi dal lancio le vendite di Super Mario Odyssey hanno superato il milione di copie sul mercato giapponese. Il dato si riferisce esclusivamente al settore retail, pertanto non viene tenuto conto delle copie provenienti dall'eShop.
Per quanto riguarda Nintendo Switch, le vendite complessive hanno raggiunto 2,98 milioni di unità, di cui 230.000 solamente nell'ultima settimana. Per avere un metro di paragone, Wii U in Giappone ha venduto in totale 3.3 milioni di copie, mentre PlayStation 4 si trova attualmente a quota 5.7 milioni.