Dopo una dura giornata passata a fare le solite cose da supereroe verme della terra, Jim viene colpito sulla testa da una mucca volante.
Dopo essere cauto in un profondo coma, Jim si sveglia e scopre di essere diventato matto.
Per recuperare la sua sanità mentale dovrà viaggiare attraverso vari mondi nella tua testa e collezionare vari oggetti che lo aiuteranno a tornare normale.
Naturalmente, non sarà facile recuperare tutto ciò: Jim potrà disporre delle sue abilità, come saltare, strisciare, correre, sparare ai nemici e tanto altro.
Tutto il gameplay che vi aspetteereste da un EarthWorm Jim, ma in 3D.